一般大多数滴眼液都是不能长期使用的，但若患者需要长期使用滴眼液，也应当尽量选择不含防腐剂的药物。
长期使用含有防腐剂的药物，对眼表面有一定的损害，可能会诱发干眼症。若患者长期使用含有抗生素的滴眼液，有可能会导致细菌耐药，影响药物治疗效果。
一些含有血管收缩剂或者激素的药物不可长期使用，否则可能会引起继发性青光眼，而严重危害患者的视力。但若是不含防腐剂的滴眼液，这种是可以长期使用的，同时还应该注意视力的情况。