脑干胶质瘤引起的原因有很多种，首先，一些遗传基因方面的因素导致。比如有一些家族肿瘤的高发病史，有先天性的基因突变或者基因位点缺失，这种情况有可能会得脑干的胶质瘤。
另外，一些后天的因素导致。比如患者长期抽烟、喝酒，喜欢吃一些熏制的肉类，或者长期接触一些有毒的化学性物质，例如一些皮革厂的工人，这种情况有可能会导致脑干胶质瘤发生。
另外，患者脑部受过一些病毒的感染，这种情况下也会导致基因突变，导致一些肿瘤细胞的发生。患者长时间接触一些放射线，头部做过放疗或者长期玩手机、电脑，这种情况下可能会引起脑干的胶质瘤。