右附件囊肿是否影响怀孕，得区分囊肿的性质，不能一概而论。
右侧囊肿可分为生理性囊肿和病理性囊肿，生理性囊肿体积小，主要指滤泡囊肿、黄体囊肿，不影响生育，并且可以自愈。
而病理性囊肿分类则较多，如畸胎瘤、卵巢黏液性囊肿、巧克力囊肿等。其中巧克力囊肿的患病率比较高，对生育影响非常大，有临床报道，巧克力囊肿的女性不育率能高达50.9%，因为会破坏卵巢组织、降低卵巢储备功能，所以影响受孕。也有的囊肿具有内分泌功能，会引起内分泌紊乱，所以也会导致月经失调、不孕等情况。
所以，附件有囊肿的女性，要进一步检查囊肿的性质，若是病理性囊肿，必要时经过合理的治疗再考虑备孕。