脑干血管堵塞是很严重的。血管阻塞意味着脑干梗死，因为脑干部位神经核团密集，并且脑神经分布众多，即使梗塞部位较小，也很容易导致伤及神经。并且极易迈过中线伤及双侧神经，例如语言不利、肢体感觉功能障碍、肢体运动障碍，甚至导致死亡。
1.语言不利。因为脑干上有舌咽神经和舌下神经的核团，当这两个核团受损后，会出现发音不清，还会出现饮水呛咳、吞咽困难等症状。
2.肢体感觉和运动障碍。有大量的上行纤维和下行纤维通过脑干，例如脊髓、丘脑束、网状结构。如果这些神经被损伤，影响神经电生理正常传导，就会出现运动障碍和感觉障碍，例如麻木、疼痛、活动不利等。
3.意识障碍。脑干有一个重要的结构叫网状结构，包含了网状上行激活系统，是呼吸、意识等生命体征的重要维持结构。如果血管堵塞引起脑干梗死，就会导致这个结构出现功能紊乱，产生昏迷甚至死亡。