反流性食管炎会造成食管癌。患有反流性食管炎，治疗不及时，首先会造成食管狭窄，主要是因为食管黏膜的糜烂形成疤痕。疤痕部位还会发生挛缩，从而造成食管管腔的狭窄。
发生食管狭窄的病人会出现吞咽困难，这种情况开始是间断性发生、时有时无。随着病程延长，症状也会日渐明显。当食管黏膜糜烂损伤的血管壁时会引起出血，若出血量大时，病人会发生呕血。
有些病人食管下段的黏膜可能发生病变，这种病变被称为是胃食管反流的并发症，也是公认的癌前病变及食管癌的高危因素。