绝经后卵巢囊肿有些会自行消失，有些并不会。
比如一些生理性的卵泡黄体囊肿，绝经以后没有激素的刺激，很多都是会自行消退的。还有一些巧克力囊肿，绝经以后，体内激素水平下降，也会逐渐萎缩。也有很多单纯性的囊肿，或者绝经以后会持续存在，但如果定期复查没有继续生长，一般也是没有关系的。
小于五公分以下的卵巢囊肿，如果没有腹痛、腹胀等一些症状，肿瘤标志物是正常的，可以暂时不予以治疗，定期复查就可以。如果短时期内囊肿生长速度比较快，那就要警惕恶变的可能，建议尽早手术治疗。