排卵障碍的危害，首先就是不能够顺利怀孕。也会因为患者排卵障碍而常常没有正常的月经周期，也有的人月经会推迟很久的时间才来，也有的人就会因此而发生子宫内膜不能正常剥脱，有严重的异常出血的问题，而导致子宫内膜病变的几率增高。
所以有排卵障碍的人群，有生育要求的情况，是需要尽早地做内分泌的检查，做内分泌的调理，尽早地促排卵治疗来帮助怀孕。
有严重的月经失调的情况，也是必须尽早地做治疗，必要时也有的需要做诊断性刮宫，以预防子宫内膜病变。