憋尿后小腹疼痛是因为膀胱扩张，导致膀胱肌肉牵拉所引起的牵拉疼痛，而扩大的膀胱有部分进入腹腔，所以感觉疼痛部位位于小腹。
在憋尿时，膀胱内的尿液积聚逐渐增多，对膀胱壁产生的压力逐渐增大，为了能够容纳更多的尿液使得膀胱逐渐扩大，就会造成膀胱壁肌肉伸展。当达到一定程度时就会出现疼痛症状，此时需要及时排尿，以避免膀胱内的压力超过膀胱肌肉所承受的极限，而出现膀胱破裂等严重的并发症，而且频繁憋尿容易引发尿路感染或者膀胱结石的发生，所以建议不要频繁憋尿。