小儿热带巨脾综合征的治疗，要根据小儿出现的症状来采取药物治疗，对于有脾脏肿大的小儿，必要时还需要手术来治疗。
引起小儿发病的原因主要是因为疟疾感染，尤其是夏天被带有病毒和细菌的蚊子和虫子叮咬后，小儿首先会出现肚子胀、拉肚子、厌食等症状，随着病情的进展会出现脾脏肿大，有的小儿还会出现肝脏肿大等症状，一定要及时带小儿去医院住院治疗。
经过长期的按疗程应用抗疟药物治疗就会恢复，同时还要注意保持居室内有纱窗，避免蚊子飞进来，还要做好灭虫工作。