输液容易损伤人的静脉血管，导致凝血功能增加或者输液不慎，输液中混入空气，都可能使肺血栓形成或加重，所以肺血栓患者应注意尽量不要输液。
发现有肺栓塞后，医生会对它危险分层，根据分层的不同、治疗不同，通常都是选用口服抗凝或者溶栓药物治疗。抗凝是基本治疗方法，应用的抗凝药物有肝素、低分子肝素钠等。危险分层为高危的患者选择溶栓药。
除了口服用抗凝或者溶栓药外，当患者没有办法接受其它治疗方案或治疗无效或者情况非常凶险，等不及用药物治疗时，需要选择手术治疗。