胃肠型感冒是否可以自愈，主要取决于病情的严重性以及患者的基础状态等多因素有关。
如果是为轻度的胃肠型感冒患者，而且患者既往身体健康，通过嘱患者早期注意休息，保持良好的生活习惯，避免熬夜、劳累、多饮水。饮食上以清淡的、易消化的软食为主，必要时可以口服一些流质饮食，大部分患者经过2-3天是可以自愈的。
但要注意在观察期间，如果临床症状无明显缓解或重度的胃肠型感冒患者，此时要早期予以针对性的处理。因为重度患者可以出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻症状明显，严重者可以出现虚脱的表现，还可以导致酸碱电解质平衡紊乱、休克等临床症状。
早期予以补液、抗病毒、退热、止吐、抑酸护胃的综合治疗，胃肠型感冒总体预后良好。