病毒性肺炎的治疗，首先要予以相应的抗病毒药物治疗。虽然目前无特效的抗病毒药物，但还是需要根据不同的感染的病毒，选用相应的抗病毒药物。
例如由流感病毒引起的病毒性肺炎，此时多需要予以抗流感病毒的药物，例如奥司他韦抗病毒治疗。如果是由单纯疱疹病毒引起的病毒性肺炎，患者还可以使用阿昔洛韦抗病毒。如果是由巨细胞病毒引起的病毒性肺炎，可以使用更昔洛韦抗病毒治疗。
在抗病毒治疗同时，要加强支持对症处理。因为病毒性肺炎常容易导致双肺间质性的改变，并形成重症肺炎。患者多需要予以氧疗，必要时可以予以高浓度吸氧、面罩吸氧改善机体的缺氧状态。多予以有效的祛痰平喘对症处理，部分患者出现高热还予以物理降温或口服双氯芬酸钠缓释片来降温。加强维护器官功能的稳定，部分患者还需要使用呼吸机的辅助呼吸治疗。
有时病毒性肺炎可以继发其他器官功能损害，例如：肝肾功能以及心功能等损害，要加强维护器官功能、防治并发症等治疗。