对于军团菌肺炎可以根据病人的症状来诊断，病人会出现寒战、咳嗽，还有发热等呼吸道症状。
另外，军团菌肺炎病人做胸部X线检查的时候会发现有浸润性的阴影，还有可能会有胸腔积液，病人的呼吸道还会有分泌物出现，可以做血液、痰液或者胸水培养，如果发现有军团菌生长则可以确诊。也可以采用荧光法检测病人的呼吸道分泌物，如果呈现阳性，荧光法检测血液则会发现抗体滴度呈四倍或者四倍以上增高。
确定有军团菌肺炎的情况下，需要及时地采用大环内酯类抗菌药物予以抗感染治疗。