军团菌肺炎有可能复发。军团菌肺炎主要是由于患者的下呼吸道受到军团杆菌的侵袭，造成患者细胞内细菌感染，进而引发一系列临床症状的呼吸系统疾病。
在军团菌肺炎的治疗过程中治疗方案是否有效，取决于药物的抗军团菌活性和抗菌活性肺泡内巨噬细胞内的浓度。关于军团菌肺炎的治疗，建议使用大环内酯类药物或喹诺酮类药物单药进行早期诊治。
由于军团菌抗感染治疗是否有效，不能以患者症状为主要观察目标，影像学检查也具有一定的延迟性，因此军团菌肺炎的患者需要进行2~3周的治疗时间。若治疗时间较短，则可能引起复发。