就疾病病因沙眼是慢性传染性疾病，是由特定的病原体沙眼衣原体感染导致的慢性角结膜炎。而结膜炎是一大类疾病可由细菌、病毒等理化因素刺激引起急性细菌、病毒性结膜炎。
二者都有一定的传染性，但结膜炎一般很少累及角膜，一般不影响患者的视力。
沙眼可以导致角膜血管翳引起明显的视力下降并且沙眼还可以导致眼睑瘢痕，导致睑内翻、倒睫等。沙眼有其特征性改变比如角膜血管翳、双眼下睑外观样改变、眼睑瘢痕等，结膜炎的疾病范围较大无特征性病变。