头皮针根据头部皮肤的解剖位置，可以分四区，分别为额区、顶区、颞区和枕区。
额区分为额中线、额旁一线、额旁二线、额旁三线，其位置均在头前部，主要治疗的是精神系统疾病、癫痫等。顶区分为顶中线、顶颞前斜线、顶颞后斜线、顶旁一线、顶旁二线，均在头顶部，主要治疗的是神经系统疾病，包括中枢神经系统疾病和周围神经系统疾病。
颞区分为颞前线、颞后线，在头的颞部，主要治疗偏头痛、耳鸣、耳聋。面瘫等。枕区分为枕上正中线、枕上旁线、枕下旁线，均在后头部，主要治疗的是视力疾病、眼部疾病以及小脑平衡障碍等。