患上扁桃体结石后是否有必要切除扁桃体，需要根据病情的严重程度来判断。
在扁桃体结石的初次治疗时，一般不建议直接切除扁桃体。较小的结石可以选择通过负压吸引，或者是使用专业的工具将其取出。较大的结石也可以选择对黏膜进行切开的方式，来进行取出治疗。结石处理干净之后，同时配合消炎等的治疗，预后通常比较好。
但如果患者的扁桃体结石反复发生或者是比较顽固，且在保守治疗之后效果不理想，或是长时间存在咽喉部位的不适以及口臭等异常表现，可以选择直接对扁桃体进行切除。