儿童偏头痛可以用口服药物治疗，选择主要应用是布洛芬或扑热息痛，以及钙离子阻滞剂，如尼莫地平。
患有长期偏头痛的儿童会对药物产生一定的耐受性，因此重要的是从自我调解开始，包括减轻心理压力，在心理上放松，消除紧张，增强对疾病的信心，并让孩子确保良好的睡眠，所有这些都能有效地缓解偏头痛。
儿童偏头痛也要特别注意饮食和避免刺激性食物。如果孩子有抑郁症，也可以使用抗抑郁药物，如阿米替林；如果孩子有惊厥，也可以使用抗惊厥药物。