牙窟窿补上还疼，通常可以考虑有以下几种原因：
1.牙齿龋洞比较深，过于接近牙髓腔。如果在补牙的时候没有进行垫底，直接用充填材料进行充填，充填材料会渗出一部分物质。渗出的物质就会刺激到牙髓，从而引起剧烈的疼痛感。建议去除充填材料，经过垫底后再进行二次充填。
2.龋洞内的细菌已经深达牙髓腔，引起局部的牙髓炎症。充填后牙髓内部的炎症并没有得到有效地控制，从而引发肿胀，所以还会出现剧烈疼痛的现象。
建议在医生的指导下用药消除炎症，日常需要保持口腔卫生，早晚刷牙，饭后漱口。