头皮部位如果有真菌，一般首先需要判断这种真菌是否形成炎症的刺激反应，或者造成头皮的明显感染。
如果通过相应的检查证实头皮有真菌，只要没有相应的皮肤损害，大多不需要做特别的治疗。但是如果这种真菌已经形成一定的皮肤疾病，比如造成头癣或者是形成一定的脂溢性皮炎等，就需要进行相应的治疗。
如果形成头癣，特别是皮肤癣菌感染而造成的这种疾病，就需要口服抗真菌类的药物达到治疗目的，比如可以口服伊曲康唑等。