肺动脉闭锁最常见的并发症就是心力衰竭以及心排出量异常，病人在出生以后会迅速出现严重的缺氧症状，一般出生以后在婴幼儿时期死亡率相对要高，即使幸存以后也会有严重的心脏畸形，愈后非常差。
肺动脉闭锁是一种危及生命的严重的心脏畸形，目前的治疗，有条件的还是应该尽快进行手术，但是手术的风险也比较大，病人症状出现以后要进行系统的检查，根据病人的状态制定手术方案，选择最合适的治疗措施。
肺动脉闭锁不能够延误治疗，延误就诊，通常会错过最佳的治疗时间，而造成病人的死亡。