卵巢妊娠如果手术只是把胚胎组织取出没有切除卵巢，手术后卵巢功能会逐渐恢复正常，不会影响以后怀孕。
但是如果卵巢妊娠引起卵巢破裂后，因为会引起大出血症状，手术的时候一般会切除卵巢避免引起严重并发症。切除一侧卵巢，只要另一侧卵巢功能正常也不会影响正常怀孕，而且不会影响正常月经周期等。
所以发生卵巢妊娠的女性即使手术切除了一侧卵巢，也没有必要过度担心。如果卵巢妊娠能够早期采取腹腔镜手术，消除胚胎组织，双侧卵巢都会具有正常生育功能。