尿道结石的治疗应根据结石的位置选择适当的方法，不同部位结石，采用方法不同。
1.比如结石位于尿道舟状窝，可向尿道内注入无菌液体石蜡，然后将结石推挤出尿道口，或者用血管钳子经尿道口伸入将结石取出。 2.前尿道结石采用阴茎根部阻滞麻醉下，压迫结石近端尿道，阻止结石后退，注入无菌液体石蜡，再轻轻向尿道远端推挤，勾取或钳出，取出有困难者可选择输尿管镜下碎石后取出。切忌处理粗暴，尽量不做尿道切开取石，以免尿道狭窄。
3.后尿道结石可用尿道探条将结石轻轻地推入膀胱，再按膀胱结石处理。