肛门不卫生会引起肛裂。肛门不卫生会使肛管内齿线附近产生炎症，炎症可以波及后正中位的肛窦处产生肛窦炎，炎症蔓延形成皮下脓肿，在肛管处破溃，而形成慢性溃疡，导致肛裂。
产生肛裂的其它因素还有便秘，便秘时粪便干硬、排出困难，粪便通过肛管时擦伤肛管皮肤，撕裂肛管造成裂口。
内括约肌痉挛也会引起肛裂，外界因素导致内括约肌张力增高，肛管静息压也随之增高，使肛管的舒展性差，当干硬的粪便通过肛管时会产生裂口，其它的因素还有解剖因素等。