霉菌性阴道炎和滴虫性阴道炎，从临床表现、病原体、病因和治疗方法上都有着区别。
霉菌性阴道炎的典型临床症状是阴道瘙痒、烧灼感、豆腐渣样阴道分泌物，病原体为假丝酵母菌。常见的诱发因素有应用广谱抗生素、糖尿病、大量应用免疫抑制剂与雌激素、肥胖、穿紧身内裤等。诊断标准为在阴道分泌物中找到假丝酵母菌的芽生孢子或假丝酵母菌即可确诊。治疗是采用唑类或制霉菌素类药物，除药物治疗外还需要消除诱因，性伴侣不需要同时治疗。
滴虫性阴道炎的主要症状为阴道分泌物增多、外阴瘙痒，典型的阴道分泌物特点是稀薄脓性、黄绿色泡沫状、有臭味。病原体为阴道毛滴虫，患病原因主要是通过性交直接传播。诊断标准是在阴道分泌物中找到滴虫就可确诊。治疗通常选用甲硝唑或替硝唑，性伴侣需要同时治疗。