霉菌性阴道炎需要与其他类型的阴道炎，如滴虫性阴道炎、细菌性阴道炎、萎缩性阴道炎、宫颈炎等相鉴别。
霉菌性阴道炎的症状，主要是表现为分泌物增多、重度的瘙痒，有时会阴部位有烧灼感、尿痛等。而细菌性阴道病和滴虫性阴道病，一般只是分泌物增多，瘙痒程度较轻。霉菌性阴道炎的分泌物是白色的，呈豆腐渣样。细菌性阴道炎，一般就是有腥臭味。滴虫性阴道炎，是脓性的、泡沫状的稀薄状分泌物。
最主要的鉴别是需要查阴道分泌物检查，通过显微镜下，看有没有芽生孢子、菌丝、滴虫、线索细胞，这些是区别三种阴道炎最主要的实验室检查办法。