新生儿出现肠梗阻后，恢复的时间与梗阻原因，以及严重程度等有很大的关系。
如果新生儿肠梗阻是胃肠生理活动异常引起，通过保守治疗，随着胃肠功能恢复，一周左右就能恢复。如果肠梗阻症状较严重，可能是生长发育异常造成，一般需要手术治疗，则需半个月以上才能恢复。
新生儿肠梗阻一般分为动力性肠梗阻，和先天性肠道发育不全。如肠管发炎、肠管套叠、肠管肿瘤等，属于动力性肠梗阻，可以采用保守治疗。而先天性肠闭锁、肠粘连、先天性肠狭窄、先天性巨结肠、十二指肠闭锁等，属于先天性肠道发育不全造成的肠梗阻，一般需要手术治疗。