单纯性脊柱结核多是由肺结核引起，可能患者本身有肺结核，也可能患者长期与肺结核患者接触。
肺结核病人咳嗽或打喷嚏时，唾液、飞沫等可污染空气，造成肺部感染，或者污染的食物可造成胃肠感染。之后再经血液循环沉积在骨骼之中，造成骨与关节的感染。
单纯性脊柱结核占全身骨关节结核的首位，其中以椎体结核占大多。椎体以骨松质为主、负重大、承受应力高，而椎体的滋养动脉多为终末动脉，结核杆菌容易停留在椎体部位。在整个脊柱中腰椎活动度最大，腰椎结核发生率也最高。