肝穿刺活检的目的不同，部分目的的肝穿刺可用其他检查来替代。肝穿刺活检的作用主要有以下两方面：
1.确定肝脏结节的性质。肝脏结节有肝硬化结节和肝癌结节，对于肝脏结节性质不明的情况，需要进行肝穿刺活检取得病理。这一类情况可以通过肝脏增强磁共振或增强CT，或者肝脏血管造影来替代肝穿刺，以明确肝脏结节的性质。
2.肝穿刺活检的作用是查明肝功能异常的不明原因。因其肝功能异常的原因有很多，经反复各项实验室检查和影像学检查都不能明确的，需要进行肝穿刺活检。对于这一类情况没有检查可替代肝穿刺，只能进行肝穿刺活检。