肛周脓肿有可能会引起小腹胀痛，主要是一些高位的肛周脓肿，例如高位直肠粘膜下脓肿、骨盆直肠间隙脓肿以及直肠后深间隙脓肿等，这类肛周脓肿位置偏高，会刺激直肠上端或者乙状结肠，造成患者出现下腹部疼痛症状。
还会刺激患者逼尿肌，导致逼尿肌痉挛而出现排尿困难，会引发患者出现肛门坠胀、产生频繁的排便刺激以及排便困难等症状，使患者坐立不安。
高位的肛周脓肿还容易引发患者出现发热、畏寒、寒战等全身症状。