茎突综合征会引起嗓子和咽疼。主要原因有以下几个方面：
1.茎突综合征的患者，主要是茎突过长、倾斜的角度过大，过长的茎突会直接影响到患者的咽喉的部位，产生嗓子疼和咽疼的感觉，这是患者最常见的症状之一。这种疼痛主要是在咽部的扁桃体或者是舌根的地方，通常不是特别强烈，多表现为一侧的疼痛。
2.导致茎突综合征的原因有可能是扁桃体炎，扁桃体炎是扁桃体的部位发生细菌感染，其可以出现咽疼，严重的会导致吞咽困难。