心肌炎康复后是否有后遗症，取决于心肌炎恢复的情况，如果是急性心肌炎的发作，大多为病毒性心肌炎，主要是呼吸道感染后，病毒侵犯心脏，造成心肌损害，出现心肌缺血、缺氧，发生心悸、胸闷、气短等症状，同时还会出现早搏等心律失常的表现，但这种心肌损害是可逆性的，通过抗病毒、营养心肌等对症治疗后，同时要限制活动量，基本1~3个月后可完全康复。
这种情况不会遗留后遗症，但是如果患者机体免疫力低下，反复呼吸道或者急性心肌炎治疗不彻底，发展为慢性心肌炎，出现迁延不愈，发展为慢性心肌炎时，不仅恢复时间延长，而且达到完全康复的几率也会减少，就会遗留心律失常、心悸、气短等后遗症。
主要是因为慢性心肌炎导致心肌慢性缺血、缺氧改变后，出现心脏功能下降、心肌收缩力减弱导致的。