肛瘘不能用药膏治愈，肛瘘都需要通过手术治疗才能完全治愈。
肛瘘使用药膏只能控制肛瘘急性发作的症状，当肛瘘瘘管内出现感染时，会导致患者肛门局部出现肿痛的症状，并且会伴有流脓症状。此时外用一些药膏，例如痔疮膏或者抗生素类的软膏，可以缓解局部肿痛的症状，控制局部的感染。
但控制了症状，肿痛症状消失并不代表肛瘘已经治愈，只不过是肛瘘进入了发作间歇期，后期还是会再次出现急性的感染，引发肿痛以及流脓的症状。所以建议肛瘘患者及时行手术治疗治愈肛瘘，以免症状反复发作。