神经皮肤综合症主要依靠症状以及检查来帮助诊断，早期症状为结节状隆起，有时有蒂，与皮肤色泽一致或呈暗红色，大小由数毫米至数厘米，数目多少不等，多见于躯干、四肢及头部较少，如肿瘤压迫神经，可引起疼痛或功能障碍。
晚期症状为进行性视力丧失、视神经萎缩、局部疼痛或眼球突出，单侧或双侧听神经瘤往往在10岁以后发生，表现为听力丧失、耳鸣、眩晕及面肌无力。
检查可选择血沉、碱性磷酸酶、免疫球蛋白、血电解质、甲胎蛋白、脑脊液等检查，并根据临床选择X线、B超、脑CT、脑电图、泌尿系造影等各项检查。