治疗肾结石的方法有很多，对于较小的肾结石，如果患者没有任何症状以及体征，可以不予治疗，也可以通过多饮水，做倒立的体位，促进结石自行排出，可以通过药物排石，比如说排石颗粒、结石通颗粒等。
而对于有症状的肾结石，可以选择体外冲击波碎石术。如果结石位于上盏或中盏，可以选择输尿管软镜取石术，对于较大的肾结石。如果直径超过2.5厘米，且结石为多发性，目前可以选择经皮肾镜碎石取石术，对于有禁忌症的患者，可以选择开腹情况下的肾脏切开取石术。