如果在怀孕期间发现有甲状腺功能亢进症，需要在医生的指导之下，来决定是否需要流产，绝大多数是并不需要流产的。
因为在孕期发现有甲亢，只要经过正规治疗，对孕妇及胎儿的影响都是很小的。但不要自行盲目用药，一定要在医生的指导之下。抗甲亢用药包括甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶，在孕期的不同阶段，甲亢用药也是完全不同的。
在早期需要应用丙硫氧嘧啶，如果应用甲巯咪唑，可能会致畸。所以孕期有甲亢的患者，不要盲目选择用药，同时还要定期复查甲功。