甲状腺炎可以由病毒感染引起，但并非所有的甲状腺炎都是由病毒感染引起的。
由病毒感染引起的甲状腺炎主要指的是亚急性甲状腺炎，但是对于这种类型的甲状腺炎，由于本身属于一种自限性疾病，病情发展到一定阶段以后便自动停止不再进展，而是进入恢复期，所以一般不需要临床进行明显的对因治疗，必要的时候进行止痛、抗炎对症治疗即可。
而像急性甲状腺炎，一般是由细菌感染引起的，应采用合适的抗生素，比如阿奇霉素抗感染治疗即可，病情严重的可能需要手术排脓治疗。