阿米巴痢疾需要结合患者的临床表现和检查结果确诊。
如果患者出现腹痛、排果酱样大便的表现，而且近期有不洁饮食史要高度怀疑阿米巴痢疾，可以化验大便常规。如果大便中找到阿米巴滋养体，可以明确诊断。如果大便中没有找到阿米巴滋养体，可以进一步做电子结肠镜检查。如果肠镜下看到肠道有溃疡，可以在溃疡组织边缘做病理检查，如果查到阿米巴滋养体，也能确诊阿米巴痢疾。此外，还可以抽血化验阿米巴抗体，如果抗体阳性，结合患者的临床表现，也能诊断阿米巴痢疾。
阿米巴痢疾诊断明确后建议及时治疗，可以用驱虫药，比如甲硝唑，同时建议定期复查电子结肠镜。