跑步后心跳不规律，可能是出现了心律失常。窦性心律失常就可以出现心跳不规律；但是，对于这一种心律失常相对临床意义并不是很大，没有必要做特殊的处理。
也有可能出现了频繁的早搏，包括房性早搏、室性早搏和交界性早搏等；还有可能发生了二度房室传导阻滞。如果患者本身就有心脏方面的疾病，还有可能出现了病态窦房结综合征，或者引起了心房颤动，对于这一些心律失常，需要做积极处理的。
但是，需要先通过心电图或者心脏电生理检查来明确心律失常的类型，才能选择最合理的治疗措施。