脊膜膨出和骶尾部的畸胎瘤特别容易混淆。脊膜膨出是指的在脊柱裂的基础上，脊柱内的脊膜和脑脊液通过裂口向椎管外膨出，一般多出现在腰背部的一个肿物或者肿块，呈圆形或者是椭圆形，并且肿块的表皮比较薄。
而骶尾部的畸胎瘤位置比较低，并且大小并不一样，它的形状同样是不规则的；并且，畸胎瘤的硬度并不均匀，肿物内常有实质性的组织例，如牙齿、软骨等。
而且，囊性畸胎瘤它的透光实验是阳性，因为畸胎瘤并没有与椎管相通，所以压迫肿物时，囟门并没有冲击感；而脊膜膨出的患者压迫肿物时，囟门会有冲击感，X线显示畸胎瘤并没有腰椎或者骶椎的骨质缺损。