角膜炎的治疗原则是控制感染、减轻炎症反应、促进溃疡愈合和减轻瘢痕形成。细菌性角膜炎选用敏感的抗菌药物进行治疗，根据病情和经验，选择一种或多种广谱抗生素。当实验室检查明确病原菌后再调整，给予敏感抗生素，做进一步治疗。
抗真菌药物是治疗真菌性角膜炎的重要手段，多采用联合用药的方法，以提高疗效。单疱病毒性角膜炎可使用抗病毒药物治疗，防止复发。
并发虹膜睫状体炎时，轻者可以用短效散瞳剂如托吡卡胺眼药水滴眼，炎症厉害的需要用1%的阿托品眼药水或眼膏散瞳。
药物治疗无效或角膜溃疡穿孔或即将穿孔，应采取包括角膜移植在内的手术治疗，术后继续药物治疗。