支原体感染时，需要根据患者临床症状完善以下检查。
如果是以呼吸系统的症状为主，通常需要行血常规、C-反应蛋白、降钙素原、血沉、肝肾功能电解质心肌酶谱、胸部X线或CT检查，以及支原体的特性IgM和IgG抗体检测。当患者支原体IgM抗体为阳性时，则考虑有支原体的感染。如果其胸部影像学检查，有相应的炎性病灶形成，则考虑有支原体肺炎的出现。如果患者是以泌尿系统的症状为主，例如尿频、尿急、尿痛、发热等症状，患者需要行尿常规、尿培养以及支原体的相应抗体检测、腹部彩超的检查。
故临床上通过上述检查，来明确支原体的感染部位、严重程度等。