胆固醇偏低的危害，主要是和引起胆固醇偏低的原因相关。
如果是服用他汀类药物治疗引起的胆固醇偏低，这种情况一般不会有危害，属于药物治疗的正常反应。如果是其他疾病引起的胆固醇偏低，比如甲状腺功能亢进引起的胆固醇偏低，如果没有及时控制甲亢治疗，随着疾病的进展，会引起一系列的并发症发生，比如心脏方面出现甲亢性心脏病，引起心力衰竭发生，严重的甚至引起恶性心律失常，导致心脏骤停，引起猝死现象发生。
如果是恶性肿瘤引起的胆固醇偏低，早期没有及时发现，随着肿瘤的恶化加重，也会影响患者的寿命。