不动纤毛综合征患者的动力蛋白可能有缺陷，本病是由于遗传或者环境因素导致纤毛的结构部分缺失，或者形态发生改变，导致摆动障碍。而动力蛋白是纤毛的一种组成成分，其经过一系列的变化引起纤毛运动，纤毛的摆动障碍可能是与它有关的。
当发生本病时，主要是对症治疗。如果有感染存在，需要结合药敏试验的结果，用阿莫西林、哌拉西林等抗生素治疗，还可以用祛痰药降低痰液浓度，如氨溴索、乙酰半胱氨酸等。
本病在肺功能明显下降前，接受正规治疗，可以明显改善症状，提高生存率。