肺栓塞相对于还是容易出现误诊。肺栓塞的症状和体征并无特异性，因肺栓塞的栓子大小、栓塞肺血管的范围不同，其临床症状变化也较明显，临床表现有时也可以不典型而容易误诊。
部分患者可能无明显的咯血、呼吸困难、胸痛的典型三联征，患者可能以晕厥、腹痛、发热等为其表现，少数患者甚至猝死、来不及诊断，此类患者易发生误诊或漏诊。
部分较小的肺栓塞患者，可能仅以轻度的短暂胸痛和活动后轻度气促，而无明显呼吸困难和咯血等表现。
另外，部分不典型的患者还容易与心绞痛、心肌梗塞以及肺炎、胸膜炎、主动脉夹层动脉瘤、血管神经性晕厥等疾病发生误诊。故对于易发生肺栓塞的高危患者，要早期行肺动脉CT造影检查以避免误诊。