化脓性扁桃体炎是会复发的，其复发的原因有以下几点：
首先，如果患者未彻底地控制扁桃体局部炎症，扁桃体窝局部容易潴留细菌和分泌物，特别是慢性扁桃体炎的患者，此些原因容易导致扁桃体炎复发。
此外，如果既往有过化脓性扁桃体的人员未注意休息、抵抗力下降或仍继续抽烟、喝酒，吃辛辣、刺激的食物，也容易诱发化脓性扁桃体炎的复发，特别是容易感冒的患者。
小孩则可以因为免疫系统还不成熟，免疫力相对于低，容易受凉等因素，而导致扁桃体局部防御功能下降而容易使细菌入侵，使其再次复发化脓性扁桃体炎。