鳞癌和腺癌主要是肿瘤细胞不同。
鳞癌以局部病变为主，腺癌更容易远处扩散转移。鳞癌生长较慢，腺癌有多种结构，生长速度较快，且早期易转移。
鳞癌像是表层的，多见于鳞状上皮覆盖部位的恶性肿瘤，多发于皮肤、口腔、食管、宫颈、阴道等。腺癌相对更深层一些，像是内部的，是上皮组织中的腺上皮发生恶变而导致的恶性肿瘤，多发于胃肠道、胰腺、肺部等。
鳞癌的形状多为菜花样，溃烂发生时会伴有腥臭和脓性分泌物。腺癌多有明显条索状和实性团块，腺癌要比鳞癌的恶性程度更高。