阴茎有异味，多考虑可能是男性在平时不注重阴茎局部卫生，不经常清洗阴茎或者长时间不换内裤所引起。尤其是存在包皮过长的男性，自身的包皮会分泌出较多的皮脂，而且容易与残留的尿液相混合，如果没能及时清洗很容易形成包皮垢，包皮垢在包皮内板部位长时间堆积，就容易出现难闻的异味。
也可能为龟头炎所致，由于龟头部位存在炎症感染，炎性产物的刺激容易导致分泌物增多，还可伴有局部充血、肿胀，甚至严重者可出现龟头局部糜烂，也会散发出难闻的异味。
另外，还可能为阴茎癌所致，该病会导致阴茎分泌大量的脓性分泌物，也会出现异味。