支原体感染挂哪个科室，需要根据患者的临床症状而决定。支原体可以感染呼吸系统，亦可以感染泌尿系统。此时如果患者是以咳嗽、发热为主，此时通常需要挂呼吸内科。呼吸科医生会根据情况，完善血常规、胸部x线或ct检查，以及支原体的相应抗体检测，来明确是否有支气管炎、支气管肺炎或者是肺炎的形成。在其明确诊断以后，予以适当的抗感染、止咳等对症处理。
如果患者是以尿频、尿急、尿痛、发热等为其主要临床表现，此时多考虑有泌尿系统的感染，需要挂泌尿外科进行相应的诊治。泌外科医生会根据情况完善尿常规、血常规以及支原体的抗体检测，当诊断明确以后，予以足剂量的抗感染治疗，此时抗感染疗程一定要足。
故支原体感染时，一定要通过相应的科室，予以有效的抗生素抗炎处理，来彻底治愈支原体感染。