肠炎宁胶囊的副作用在药物的说明书中标为尚不明确。但是在临床应用中也有部分患者用药后，可出现一些消化道的不适症状，比如恶心和呕吐，可能和药物刺激胃部有关。
还有的患者服用后可出现药物疹的副作用，这种情况应考虑对药物组方中的一些药物成分可能有过敏反应。如果有这类情况的患者不要再继续服用本药物。
肠炎宁胶囊是一种由多种中药组成的中成药制剂，主要用于治疗小儿消化不良、急慢性的胃肠炎，还有细菌性痢疾、腹泻等这类病症。应注意对症使用，有不良反应要及时停药就诊。